武藤游戏用爷爷交给他的「战斗怪兽卡」打败了海马娱乐集团的海马濑人，没想到接下来出现了更可怕更强的敌人－他就是身兼国际幻象社名誉会长同时也是设计出战斗怪兽卡的天才游戏设计家－贝卡斯.J.克罗佛多，贝卡斯用卑鄙的手法绑架了游戏的爷爷，游戏为了救爷爷必须到贝卡斯的决斗者王国展开一连串的战斗…